К основным симптомам относятся жалобы на боль, ощущение тяжести внизу живота и расстройство мочеиспускания перед наступлением менструации.
Клетки эндометрия выходят за пределы матки, где могут оседать и прорастать на брюшине, маточных трубах, в яичниках и на органах-соседях: прямой кишке, мочевом пузыре, кишечнике, а также на других органах. Крайне редко (при попадании в ток крови) эти клетки оседают в легких, гортани, почках и других отдаленных от матки органах.
Особенность эндометриоза состоит в том, что не зависимо от того, где осели клетки эндометрия, они функционируют подобно находящимся в матке, то есть ежемесячно соответственно фазам менструального цикла они разрастаются, разрыхляются, а в дни менструации кровоточат (например, при эндометриозе мочевой системы появляются кровянистые выделения с мочой, при эндометриозе прямой кишки – выделения крови из ануса и т. д.).
Ежемесячно за несколько дней до и в период менструации у женщины появляются боли в животе различной выраженности – от дискомфорта до необходимости лежать, принимать обезболивающие средства и даже до полной потери трудоспособности. Эти боли могут распространяться в прямую кишку, крестец, ягодицы, ноги, спину и т. д.
В последнем случае нередко отмечаются боли при половых контактах вплоть до полной их невозможности. В зависимости от места и степени распространения эндометриоз может сопровождаться головными болями и головокружением.
Бывают случаи бессимптомного течения даже при выраженном поражении того или иного органа.
При поражении эндометриозом любого звена половой системы (матка, маточные трубы, яичники, тазовая брюшина) может наступить бесплодие.